تشخیص سریع مایکوباکتریوم های آتیپیک در بیماران با علایم سل ریوی: ارزیابی لوکوس (qub ۳۲۳۲ (۵۹۰bp با روش vntr
چکیده
چکیده زمینه و هدف: با توجه به انتشار جهانی مایکوباکتریوم های آتیپیک، شناسایی و تشخیص این نوع از مایکوباکتریوم ها از اهمیت ویژه ای برخوردار است. اخیراً مطالعات مولکولی انجام شده با استفاده از روش های انگشت نگاری ژنتیکی که پر هزینه و وقت گیر است، لوکوس های اختصاصی مربوط به مایکوباکتریوم ها را شناسایی کرده است. در این مطالعه علاوه بر روش hsp65 pcr-rflp ، لوکوسqub3232(590bp) با استفاده از روش توالی های تکراری پشت سرهم (vntr) برای تمایز مایکوباکتریوم های آتیپیک از مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: این بررسی بر روی 371 نمونه ی ریوی و خارج ریوی جدا شده از بیماران با علائم سل ریوی انجام شد. بعد از جدا سازی و کشت این نمونه ها با استفاده از محیطlj ، تست های افتراقی شامل احیای نیترات، آزمایش فعالیت کاتالاز، آزمایش نیاسین، سرعت رشد و تولید پیگمان انجام شد. سپس حساسیت دارویی با روش نسبتی صورت گرفت dna .به روش فنل- کلروفرم استخراج و قطعه ی hsp65 توسط pcr تکثیریافت. قطعات تکثیر یافته توسط آنزیم های avaii ,hpaiiو hphiهضم و الگوی بدست آمده، روی اگارز 3 درصد الکتروفورز شد. همچنین لوکوس qub3232(590bp)با استفاده از روش vntr در نمونه های مایکوباکتریوم های آتیپیک و توبرکلوزیس کمپلکس مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت. یافته ها: از مجموع 371 نمونه، 32 نمونه (6/8 درصد) مقاوم به دارو (mdr)، 184 نمونه (5/49 درصد) حساس و 155 نمونه (41 درصد) غیر mdr گزارش شدند که 15 درصد از نمونه های mdr و 22 درصد از نمونه های غیر mdr مربوط به مایکوباکتریوم های آتیپیک بودند. از مجموع 43 نمونه ی آتیپیک، 12 نمونه، سریع الرشد (9/27 درصد) و بقیه، کند رشد (1/72درصد) بودند. از میان کند رشدها، 58 درصد مایکوباکتریوم سیمیه و 19 درصد مایکوباکتریوم کانزاسی جدا گردید. لوکوس qub3232با حساسیتی برابر 80 درصد توانست مایکوباکتریوم های آتیپیک و توبرکلوزیس کمپلکس را از یکدیگر تمایز دهد. نتیجه گیری: لوکوس qub3232 دارای قدرت افتراق بالایی بین مایکوباکتریوم های آتیپیک و تیپیک می باشد. بنابراین می توان به جای pcr-rflp ، لوکوس qub3232 را با استفاده از روش vntr برای تمایز این دو دسته مورد استفاده قرار داد