بررسی کمی و کیفی dna بلدرچین، استخراج شده با روش نمکی تغییر یافته و توالی¬یابی ژنومی آن
چکیده
استخراج dna بهصورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهشهای بیولوژیکی میباشد. در این پژوهش، dna مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز k استخراج شد. نمونههای dna بهدست آمده در مراحل آمادهسازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، pcr، هضم با آنزیمهای آندونوکلئاز، اتصال برچسب و آدابتور و در نهایت با توالییابی کل ژنوم کنترل کمی و کیفی گردید. متوسط مقدار dna استخراج شده با متوسط میزان نسبت جذب نور در 260 به 280 نانومتر برای هر نمونه بهترتیب 138 میکروگرم و 87/1 بود. فرآیندهای تکثیر، هضم، اتصال برچسب و آدابتور و توالییابی ژنومی همه نمونههای dna مورد استفاده با موفقیت کامل همراه بود. بر اساس نتایج مشخص شد که نمونههای مذکور از کمیت، کیفیت، قابلیت و پایداری لازم و حداقل آلودگی برخوردار بودند. این روش استخراج dna به سادگی، سریع، ایمن و با حداقل هزینه انجام پذیرفت.
نویسندگان و وابستگی سازمانی
- احمد احمدی — استادیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا، همدان
- حسن مهربانی یگانه — استادیار گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
- سید رضا میرایی آشتیانی — استاد گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
- اردشیر نجاتی جوارمی — دانشیار گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
- عباس پاکدل — دانشیار گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران