شناسایی، همسانه سازی و تحلیل ساختار ژن تیوردوکسین vvtrxh۱۰) h )جدا شده از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی
چکیده
جهت بررسی ساختار ژن تیوردوکسین، rna کل از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخه برداری معکوس(rt-pcr) ، کتابخانه cdna تهیه گردید. سپس ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh10 سنتز، جداسازی و در ناقل پلاسمیدی puc19 همسانه سازی شد. نتایج توالییابی نشان داد که قطعه همسانه سازی شده از ژن تیوردوکسین h حاوی یک چارچوب قرائت آزاد منفرد به طولbp 345 بوده و پروتئینی با 114 اسید آمینه را کد میکند. بررسی ترجمه پروتئینی توالی رمز کننده نشان داد که این ژن حاوی جایگاه فعال غیر معمولrcglc ، اسید آمینه تریپتوفان ویژه w و یک موتیف ساختاری درگیر در انتقال سلول به سلول در انتهای آمینوی (maee) خود میباشد. بررسی فیلوژنتیکی و نیز همردیف سازی چندگانه نشان داد که این آیزوفرم متعلق به زیرگروه i از تیوردوکسینهای h است. علاوه بر آن، توالی پروتئینی پیشبینی شده، شباهت زیاد آن را با ژن تیوردوکسین h سایر گیاهان در بانک ژن ncbi نشان داد.