مقاله

شناسایی آلل های خود ناسازگاری در ارقام و ژنوتیپ های بادام ایرانی به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr)

سید اصغر موسوی قهفرخی، محمدرضا فتاحی مقدم، ذبیح اله زمانی، علی ایمانی، اینکارنا اورتگا

چکیده

بادام (prunus dulcis l.) از گونه های اقتصادی جنس پرونوس و از خانواده رزاسه است. قسمت تجاری میوه بادام بذر خوراکی آن (مغز) می باشد، بنابراین انجام گرده افشانی و تلقیح برای تولید محصول در بادام ضروری است. اکثر ارقام تجاری بادام، خودناسازگار و برخی نیز دگرناسازگار هستند. خودناسازگاری در بادام گامتوفتیک بوده و توسط یک مکان ژنی با چندین فرم آللی و به صورت همبارز کنترل می شود. در این مطالعه آلل های خودناسازگاری 70 رقم و ژنوتیپ بادام ایرانی و 17 رقم خارجی به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز(pcr) و با استفاده از ترکیب آغازگرهای دژنره که بر اساس توالی نواحی حفاظت شده مکان ژنی ناسازگاری در جنس پرونوس طراحی شده اند، تعیین گردید. جداسازی محصول pcr روی ژل آگارز و اندازه باندهای تکثیر شده در ارقام بادام ایرانی با اندازه آلل های شناخته شده در ارقام بادام خارجی شاهد و نشانگر یک کیلو جفت بازی مقایسه گردیدند. بر اساس نتایج در 50 رقم و ژنوتیپ ایرانی ازجمله ارقام ربیع (s7s27)، یلدا (s1s7)، آذر-2(s3s4) ، حریر (s4s24)، سهند (s1s2)، زرقان-7(s1s4) ، زرقان-8 (s1s2)، منقای دیرگل (s1s13)، منقا (s7s14)، خورشیدی(s4s8) ، شیربادام (s2s4)، شمشیری (s7s24)، مامایی اصفهان (s10s12) و ژنوتیپ های a-92 (s8s23)، (s8s13) a-2، (s8s9) k-10-15، (s7s24) k-1-16، (s1s4) k-11-40و (s1s9) a200 هر دو آلل خودناسازگاری و در 20 رقم و ژنوتیپ مورد بررسی یک باند مربوط به آلل های گزارش شده قبلی مشاهده شد در حالی که اندازه باند دوم مشابه با اندازه باند هیچ یک از آلل های شناسایی شده قبلی در بادام نبوده و احتمالاً مربوط به یک آلل جدید است که برای معرفی قطعی آلل های جدید باید توالی کامل آنها تعیین گردد. تعداد 8 باند تکثیر یافته جدید بودند که اندازه آنها متفاوت با اندازه آلل های شناخته شده در بادام بود. به طور مثال ارقام مامایی، سفید و تجاری به ترتیب دارای آلل های s25، s7، s24 و باندهای جدیدی به اندازه 1250، 1000 و 1065 جفت باز بودند. در بین جمعیت بادام های ایرانی مورد مطالعه، آلل های خود ناسازگاری s4، s1، s24، s7، s12 و s2 به ترتیب بیشترین فراوانی را در این تحقیق نشان دادند. استفاده از آغازگرهای دژنره، یک روش مناسب برای شناسایی ژنوتیپ ناسازگاری در ارقام و ژنوتیپ های بادام می باشد.

اسناد مشابه

  • شناسایی مولکولی لپتوسپیراهای بیماری زا به روش واکنش زنجیره پلیمراز بر مبنای ژن ligb

    مقالهطب جنوبفریبا فتوحی، fariba fotohi department of microbiology, school of sciences, islamic azad university, karaj branch, karaj, iranگروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرج، ایران مهرانگیز دژبرد، mehrangiz dezhbord department of microbiology, razi vaccine & serum research institute, karaj, iranبخش میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقاتی واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران پژواک خاکی، pzhvak khaki department of microbiology, school of sciences, islamic azad university, karaj branch, karaj, iranگروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرج، ایران رضا پیله چیان لنگرودی

    زمینه: لپتوسپیروز بیماری عفونی می باشد که به عنوان مهم ترین بیماری زئونوز شایع در جهان مطرح شده است. ligbیکی از مهم ترین پروتئین های غشاء خارجی لپتوسپیرا می باشد، ایمونوژن می باشد و تنها در لپتوسپیراهای بیماری زا وجود دارد. هدف این پژوهش تشخیص مولکولی لپتوسپیراهای بیماری زا به رو

  • شناسایی آلل‌های خود ناسازگاری در ارقام و ژنوتیپ‌های بادام ایرانی به روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR)

    مقاله۲۰۱۱علوم باغبانی ایراناینکارنا اورتگا، ذبیح اله زمانی، سید اصغر موسوی قهفرخی، علی ایمانی

    بادام (Prunus dulcis L.) از گونه‌های اقتصادی جنس پرونوس و از خانواده رزاسه است. قسمت تجاری میوه بادام بذر خوراکی آن (مغز) می‌باشد، بنابراین انجام گرده‌افشانی و تلقیح برای تولید محصول در بادام ضروری است. اکثر ارقام تجاری بادام، خودناسازگار و برخی نیز دگرناسازگار هستند. خودناسازگار

  • شناسایی آلل‌های خود ناسازگاری در ارقام بادام ایرانی به روش توالی‌یابی

    مقاله۲۰۱۴به نژادی نهال و بذرانکارنا اورتگا پاستور، ذبیح‌اله زمانی، سیداصغر موسوی، علی ایمانی

    شناسایی آلل‌های خودناسازگاری در ارقام بادام (Prunus dulcis) اهمیت زیادی در احداث باغ‌های جدید و انتخاب والدین در برنامه‌های به‌نژادی بادام دارد. به منظور شناسایی آلل‌های جدید ناسازگاری در چند رقم بادام ایرانی، قطعات مربوط به هر آلل تکثیر و محصول PCR آن‌ها خالص‌سازی شد. برای همسان

  • شناسایی اورنیتوباکتریوم رینو تراکئال به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr)

    مقاله۲۰۰۹مجله تحقیقات دامپزشکی (journal of veterinary research)منصور بنانی، سیدعلی پوربخش، مه زاد ارمی، فرزان غلامین

    چکیده اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال ( ort) به صورت یک عامل بیماریزای باکتریایی نوظهور در گله های ماکیان و بوقلمون شناخته شده است. تشخیص عفونت ort با برخی مشکلات در کشت و شناسایی قطعی باکتری با کمک خواص بیوشیمیایی آن مواجه بوده است. دسترسی به یک روش شناسایی قطعی و قابل اتکا که بتوان

  • شناسایی میکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) درنمونه های شیر خام گاو های شهرکرد

    مقالهmedical laboratory journalفرهاد شرافتی چالشتری، f shrafati-chaleshtori food health department, islamic azadدانشگاه علوم پزشکی شهرکرد رضا شرافتی چالشتری، r sharafati-chaleshtori دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران امیر شاکریان، a shakerian دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهر کرد حسن ممتاز

    چکیده زمینه و هدف: پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون بیماریای با آلودگی مزمن در ایجاد (map) نشخوارکنندگان است . این بیماری از مایکوباکتریوم آویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس می شود و سبب خسارات اقتصادی زیادی در گله های شیری جهان شده است و آن را عاملی در سبب pcr شناسی بیماری کرون در انسان

  • مقایسه انواع ژنوتیپ ویروس پاپیلومای انسانی (hpv) درمخاط بیماران مبتلا به لکوپلاکیا ودیسپلازی خفیف با افراد سالم به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr)

    مقالهمجله دانشگاه علوم پزشکی گیلانمحمدرضا صالحی، m.r salehi . dr. torabinejad dentistry research center, isfahan university of medical sciences, isfahan, iranاصفهان، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، مرکز تحقیقات دندانپزشکی دکتر ترابی نژاد فائزه خزیمه، f khozeimeh faculty of dentistry, guilan university of medical sciences, rasht, iranرشت، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، دانشکده دندانپزشکی سید محمد رضوی، s.m razavi faculty of dentistry, guilan university of medical sciences, rasht, iranرشت، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، دانشکده دندانپزشکی سید جواد کیا

    مقدمه: بهرغم اینکه لکوپلاکیا با تشخیص هیستوپاتولوژی خاصی همراه نیست ولی به عنوان ضایعه پیش سرطانی یا پیش بدخیمی در نظر گرفته می شود. ویروس پاپیلومای انسانی به خصوص انواع hpv16 و hpv18 در بسیاری ضایعات لکوپلاکیا دهانی مشاهده شده است. هدف: تعیین حضور ویروس پاپیلومای انسانی و ژنوتیپ