توالی نوکلئوتیدی و آنالیز فیلوژنتیکی ژن گلیکوپروتئینی ویروس سپتی سمی هموراژیک ویروسی (vhs) جداشده از ماهیان قزل آلای رنگین کمان استان چهار محال و بختیاری
چکیده
مقدمه: سپتی سمی هموراژیک ویروسی به عنوان جدی ترین بیماری ماهی قزل آلای رنگین کمان درصنعت آبزی پروری شناخته شده است. در مطالعۀ حاضر ژن گلیکوپروتئینی ویروس سپتی سمی هموراژیک ویروسی (vhs) شناسایی شد، و تعیین توالی و آنالیز فیلوژنتیکی برخی ویروس های جداشده از ماهیان قزل آلای رنگین کمان کشور انجام شد. مواد و روشها: نمونه های مشکوک به بیماری vhs که از مزارع پرورش قزل آلای رنگین کمان استان چهارمحال و بختیاری جمع آوری شده بود با استفاده از آزمون (rt- pcr) reverse transcriptase pcr سنجش شد. در این میان هشت نمونه به عنوان سویۀ مثبت شناسایی شد. در این تست، ژن گلیکوپروتئینی (g) ویروس ردیابی گردید و جهت تعیین ردیف نوکلئوتیدی تعیین توالی شد. نتایج حاصل از مقایسۀ ردیف نوکلئوتیدی تعیین شده در این مطالعه با توالی شناخته شدۀ ژن گلیکوپرتئینی سایر ویروس ها مطالعۀ فیلوژنتیکی شد. نتایج: نتایج حاصل از مطالعۀ حاضر نشان داد که بین صفر تا 4/7 درصد تنوع ژنتیکی در ژن گلیکوپروتئینی وجود دارد و در این میان بیشترین قرابت با ردیف نوکلئوتیدی ژن گلیکوپروتئینی درآلمان (توالی eu708818) با 100درصد تشابه و کمترین قرابت مربوط به جدایه های این ویروس در ژاپن (توالی ab672616) و ترکیه (توالیjf415091) هر کدام با 60/92 درصد قرابت مشاهده شد. بحث و نتیجهگیری: با توجه به قرابت ژنتیکی ویروس های vhs جداشده از ایران با سویه های اروپائی به ویژه آلمان و فرانسه احتمال وجود ارتباط بین شیوع بیماری vhs ایران و تخم های چشم زدۀ وارداتی از کشورهای ذکرشده وجود دارد.