تنوع زیستی باکتری های نمک دوست و تحمل کننده نمک سواحل غربی دریاچه ارومیه
چکیده
مقدمه: دریاچه ارومیه واقع در شمال غربی ایران بزرگترین دریاچه دائمی ایران و یکی از سه دریاچه شور دائمی در سطح جهان است. از چهار منطقه غربی این دریاچه نمونه برداری انجام شد و تنوع میکروارگانیسم ها با روش های مبتنی بر کشت و مستقل از کشت بررسی شد. مواد و روشها: در روش مبتنی بر کشت، باکتریهای هالوفیل و هالوتالرنت در شرایط هوازی در چهار محیط کشت mh، swn، swnln و mhln جداسازی شدند. جدایه ها بر اساس تفاوت های کلونی، واکنش گرم، رنگ آمیزی اسپور و ویژگی های بیوشیمیایی اولیه تفکیک شدند. محتوای ژنومی نمونه های محیطی آب و خاک برای بررسی های مستقل از کشت استخراج شد. با استفاده از تکثیر s rrna16 و کلونینگ کتابخانه ژن s rrna16 تهیه و 20 درصد کلون های نوترکیب حاصل تعیین ترادف شدند. نتایج: از بین 217 جدایه حاصل در روش مبتنی بر کشت ژن s rrna16 برای 52 سویه ترادف یابی شد که از نظر فیلوژنتیک در جنس های halobacillus، halomonas، planococcus، gracilibacillus، bacillus، pontibacillus، paracoccus، marinobacter، providencia، staphylococcus، alkalibacterium، sanguibacter، lysobacter، kocuria، pontibacter، salicola، micrococcus، oceanobacillus، brevundimonas، thalassobacillus، microbacterium و piscibacillus قرارگرفتند. در روش مستقل از کشت کلون های بررسی شده در جنس های salinibacter، adhaeribacter و cesiribacter قرار گرفتند. بحث و نتیجهگیری: در روش مبتنی بر کشت بین جدایه های تعیین توالی شده 18 جدایه شباهت کمتر از 7/98 درصد با سویه استاندارد نشان دادند که محدوده مرزی برای ارائه گونه جدید میکروبی بومی است. در روش مستقل از کشت کلون های بررسی شده در گروه bacteroidetes قرار گرفتند. که مشابه با سایر گزارش های موجود در مورد محیط های پر شور بررسی شده است.