شناسایی، همسانه سازی وتعیین توالی ژن mt nd۲ در مرغ های بومی خراسان
چکیده
میتوکندری مسئول تولید 90 درصد از انرژی مورد نیاز سلول می باشد. مقداری از تفاوت ها در عملکرد رشد جوجه های گوشتی و بیان فنوتیپی راندمان غذایی ممکن است مربوط به اختلاف در راندمان عملکرد میتوکندری باشد. این پژوهش بمنظور همسانه سازی و تحلیل مرغان بومی خراسان با تاکید بر ژن nd2 به منظور بررسی جهشهای احتمالی است. بدین منظور از نمونه خون مرغ بومی خراسان، dna ژنومی استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ژن، واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تکثیر ژن انجام شد، محصول واکنش بر روی ژل آگارز الکتروفورز شد. باندهای حاصل با استفاده از ناقل خطی ptz57r/t در باکتری e. coli همسانه سازی و توالی یابی شد. مقایسه نوکلئوتیدی قطعه توالی یابی شده با ژنوم مرجع چهار جهش را نشان داد و شباهت 99% در 100% طول خود با توالی کامل ژنوم میتوکندری gallus gallus در توالیهای ثبت شده میتوکندری طیور با شماره دسترسی x52392.1 (ژنوم مرجع)، gu261709.1، gu261712.1، ap006746.1، kf826490.1، hq857210.1 و ay235571.1 نشان داد. مقایسه پروتئینی نشان دهنده شباهت توالی حاصل با توالی های پروتئینی مربوط به ژن nd2 میتوکندری طیور در بانک اطلاعاتی بود به گونه ای که بیشترین شباهت، 100% در 100% طول خود متعلق به ژن nd2 در gallus gallus با شماره دسترسی bac57576.1 و کمترین شباهت متعلق به جنس ها و گونه های chrysolophus amherstiae با شماره دسترسی aaf65702.1 و tetrastes sewerzowi با شماره دسترسی abh01111.1 با 80% شباهت در 100% طول خود بود. همچنین توالی اسیدآمینه ای مرغ بومی خراسان با توالی مرجع و سایر توالی ها با شماره مرجع yp272073.1، bad11115.1، np_006916.1، adb06584.1 و adw41566.1 شباهت 99% در 100% طول نشان داد. پس از تبدیل توالی نوکلئوتیدی بدست آمده به توالی اسیدآمینه ای، با توالی پروتئینی مرجع مقایسه شد. نتیجه این مقایسه تفاوت در یک اسیدآمینه را نشان داد. در اسیدآمینه 130 لوسین که اسیدآمینه ای غیرقطبی است به اسیدآمینه غیرقطبی متیونین تبدیل شد. جهش های مشاهده شده در این تحقیق از آنجایی که منجر به تغییر اسید آمینه شده است می توان به عنوان یک پایه در بررسی های اختلالات سوخت وساز و صفات تحت تاثیر ژن mt-dna در مطالعات بعدی قرار گیرد