شناسایی، توالی یابی و تعیین پروتئین استنباطی ژن هم ساخت apetala۱ (ap۱) درخردل سیاه (brassica nigra)

چکیده

گذر به گل دهی یک تغییر فاز بزرگ در چرخه ی زندگی گیاهان است. ژن apetala1 در پیش برد مرحله گذر ونیز تعیین هویت مریستم گل نقش ایفا می کند. این پژوهش با هدف طراحی پرایمر، استخراج، شناسایی و تعیین توالی این ژن در گیاه خردل سیاه (brassica nigra)انجام شد. rna کل از گل های بالغ استخراج و برای ساخت cdna استفاده گردید. آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالی ژن های هم ساخت ap1 در گیاهان هم خانواده در سایت ncbi طراحی و در واکنش rt-pcr استفاده گردید. محصول این واکنش پس از خالص سازی تعیین توالی شد. نتایج نشان دهنده ی تکثیر قطعه ی مورد نظر از ژن به طول 618 نوکلئوتید بود که bniap1 نام گذاری شد و در پایگاه ncbi ثبت گردید. مقایسه ی توالی پروتئین استنباطی bniap1 با سایر هم ساخت های ap1 نشان دهنده ی شباهت بین 60 تا 91 درصدی این توالی با توالی های مشابه بود و این قطعه دارای 206 آمینواسید است. مطابق با این نتایج می توان پیشنهاد داد که bniap1 نیز به عنوان هومولوگ ap1 در گذر به گل دهی نقش دارد و می تواند به عنوان ژن تعیین هویت مریستم گل عمل کند.