بررسی ویژگی های مولکولی یک جدایۀ ویروس وای سیب زمینی جداشده از محصول گوجه فرنگی از شهرستان یزد بر پایۀ توالی قسمت هایی از ژنوم
چکیده
گوجه فرنگی (lycopersicum esculentum mill.) یکی از محصولات مهم در ایران و بسیاری از کشورها است. بر پایۀ یک بررسی انجام شده در سال 1392 ویروس وای سیب زمینی به عنوان ویروس غالب آلوده کنندۀ گوجه فرنگی در شهرستان یزد معرفی شده بود. در این پژوهش قسمت هایی از ژنوم یک جدایۀ انتخابی از این ویروس با نام جدایۀ t5 افزونش و توالی یابی شد. پس از استخراج rna کل از نمونۀ t5، با استفاده از آزمون rt-pcr نواحی مختلف cp، nib و p1 به کمک جفت آغازگرهای cpf/cpr، m4t/sprimer و p1/p2 افزونش و به ترتیب سه قطعه به طول 824، 1700 و 837 جفت بازی توالی یابی شد. نتایج به دست آمده از بررسی و مقایسۀ توالی آمینواسیدی و نوکلئوتیدی نواحی p1، cp و nib با دیگر توالی های موجود در بانک ژن، نشان داد که جدایۀ t5 متعلق به سویۀntn است.