شناسایی mirnaها و ایزومیرهای جدید در بافت کبد گاوهای شیری
چکیده
تعادل منفی انرژی (neb) در گاوهای شیری پرتولید در چند هفته نخست پس از زایمان رخ میدهد و به دلیل اثرگذاری منفی بر باروری و سلامتی اهمیت اقتصادی زیادی در گلههای گاو شیری دارد. بنابراین، شناسایی هر چه بهتر سازوکارهای تنظیمی مؤثر در این اختلال سوخت وسازی (متابولیکی) اهمیت دارد. یکی از عامل های تنظیمی مؤثر در neb، mirnaها هستند. به رغم اهمیت neb، سازوکارهای تنظیمی مربوط به mirnaها در این دوره به خوبی شناخته نشدهاند. در این بررسی دادههای mirna-seq مربوط به بافت کبد هشت گاو شیری هلشتاین موجود در بخش geo بانک اطلاعاتی ncbi برای شناسایی mirnaها و ایزومیرهای جدید تجزیه وتحلیل شدند. در مجموع، 291 mirna جدید که ژن همتا (همولوگ) در دیگر گونهها داشتند، و 164 mirna جدید بدون همتا شناسایی شد. بررسی عملکرد ژنهای هدف mirnaهای شناسایی شده نشان داد، این ژنها در مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) مرتبط با neb نقش دارند. افزون بر این 446 ایزومیر و 95 mirna* جدید برای نخستین بار در ژنگان (ژنوم) گاو گزارش شد. یافته های به دست آمده از این بررسی اطلاعات جدیدی برای درک بهتر نقش تنظیمی mirnaها در neb فراهم میکند.