مقایسه کارایی نشانگر rapd و modified rapd در تعیین تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی بین جمعیت های مختلف گیاه رازیانه (foeniculum vulgar)

علیرضا اطمینان، a etminan department of plant breeding, kermanshah branch, islamic azad university, kermanshah1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، گروه اصلاح نباتات لیا شوشتری، l shooshtari department of plant breeding, kermanshah branch, islamic azad university, kermanshah1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، گروه اصلاح نباتاتسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی کرمانشاه (islamic azad university of kermanshah) منصور قربانپور، m ghorbanpour faculty of agriculture and natural resources, arak universityگروه گیاهان دارویی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراکسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی کرمانشاه (islamic azad university of kermanshah) علی مهرآفرین، a mehrafarin cultivation and development department of medicinal plants research center, institute of medicinal plants, acecrگروه کشت و توسعه گیاهان دارویی مرکز تحقیقات گیاهان دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهیسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه اراک (arak university) اردشیر قادری، a qaderi biotechnology department of medicinal plants research center, institute of medicinal plants, acecr, karajکرج، گروه پژوهشی بیوتکنولوژی گیاهان دارویی، مرکز تحقیقات گیاهان دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی، صندوق پستی: 1369 – 31375 تلفن: 34764010 (026)، نمابر: 3476021 (026)سازمان اصلی تایید شده: پژوهشکده‮ ‬گیاهان‮ ‬دارویی‮ ‬جهاد‮ ‬دانشگاهی (institute of medicinal plants)

چکیده

مقدمه: گیاه دارویی رازیانه (foeniculum vulgar) متعلق به خانواده چتریان است که دارای کاربردهای فراوانی در صنایع دارویی و غذایی می باشد. هدف: در این مطالعه، تأثیر هضم آنزیمی محصول rapd - pcr به منظور افزایش کارایی نشانگر rapd در ارزیابی تنوعات ژنومی مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: پس از تکثیر dna ژنومی 15 جمعیت رازیانه با استفاده از 9 آغازگر rapd، بخشی از محصول pcr توسط دو آنزیم برشی msei و ecori مورد هضم قرار گرفت. سپس محصول pcr هضم شده و بدون هضم، با استفاده از الکتروفورز ژل آگارز تفکیک شد. برای تعیین کارآیی نشانگرها در تفکیک ژنوتیپ های مورد مطالعه، از معیار میزان اطلاعات چند شکلی (pic) و برای گروه بندی نمونه ها از تجزیه خوشه ای استفاده شد. همچنین درصد اسانس و اجزای تشکیل دهنده آن در جمعیت های فوق با استفاده از دستگاه کروماتوگرافی گازی متصل به طیف سنج جرمی تعیین شد. نتایج: مقایسه الگوی باندی محصول pcr هضم شده و هضم نشده نشان داد که استفاده از یک آنزیم چهاربازبر مانند msei برای هضم قطعات حاصل از تکثیر rapd-pcr می تواند تا حد قابل توجهی میزان چندشکلی را نسبت به روش rapd استاندارد افزایش دهد. همچنین تجزیه کلاستر بر اساس داده های حاصل از روش rapd تغییریافته، جمعیت ها را به صورت مناسب تری گروه بندی نمود. نتیجه گیری: به عنوان یک نتیجه کلی، هضم آنزیمی مناسب محصول pcr می تواند کارایی نشانگر مولکولی rapd را تا حد قابل توجهی در بررسی تنوعات در سطح ژنوم بهبود بخشد. از سوی دیگر نتایج نشان داد که میان عملکرد اسانس و تنوع ژنتیکی موجود همبستگی وجود ندارد.