بررسی مارکر پلی مورفیک rs۹۳۸۴ واقع در ناحیه ژنی gcdh مرتبط با بیماری گلوتاریک اسید یوریای نوع ۱

زهرا بدر، zahra badr department of biology, faculty of sciences, university of guilan campus, rasht, iranگروه زیست شناسی-دانشکده علوم پایه-پردیس دانشگاه گیلان-رشت-ایران زیور صالحی، zivar salehi department of biology, faculty of sciences, university of guilan, rasht, iranگروه زیست شناسی-دانشکده علوم پایه- دانشگاه گیلان-رشت-ایران علی جزایری، ali jazaeri division of genetics, department of biology, faculty of science, university of isfahan, isfahan, iranبخش ژنتیک-گروه زیست شناسی-دانشکده علوم – دانشگاه اصفهان-اصفهان-ایران صادق ولیان بروجنی، sadeq vallian-brojeni division of genetics, department of biology, faculty of science, university of isfahan, isfahan, iranبخش ژنتیک-گروه زیست شناسی-دانشکده علوم – دانشگاه اصفهان-اصفهان-ایران

چکیده

زمینه و هدف: گلوتاریک اسید یوریای نوع 1 نوعی اختلال متابولیکی عصبی می باشد که در اثر جهش در ژن رمز کننده آنزیم گلوتاریل کوآدهیدروژناز (gcdh) ایجاد می شود. اصولاً تعیین توالی به منظور شناسایی جهش های نقطه ای و دیگر تنوعات توالی موجود در این ژن استفاده می شود که بسیار وقت گیر و پر هزینه می باشد. روش دیگر بررسی پیوستگی با استفاده از مارکرهای چند شکلی مانند چند شکلی های تک نوکلئوتیدی (snp) است که برای تعیین افراد ناقل و همچنین تشخیص پیش از تولد در خانواده های دارای فرد مبتلا به کار می رود. در پایگاه های داده تعداد زیادی از مارکرهای snp برای ناحیه ژنی gcdh معرفی شده است. در مطالعه حاضر خصوصیات و همچنین اطلاع دهندگی مارکر rs9384 واقع در ناحیه ژنی gcdh مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: مارکر rs9384 در 100 فرد سالم غیر خویشاوند با روش arms pcr با بهره گیری از پرایمرهای جدید طراحی شده تعیین ژنوتیپ شد. در این مطالعه تخمین فراوانی آللی و درجه هتروزیگوسیتی با استفاده از پایگاه genepop انجام شد؛ همچنین از نرم افزار power marker برای تخمین وجود تعادل هاردی واینبرگ و میزان محتوی اطلاع دهندگی چند شکلی (pic) استفاده شد. یافته ها: نتایج حاصل از این مطالعه بیانگر فراوانی آللی مینور (maf) 0/34%، درجه هتروزیگوسیتی 0/53% و مقدار 0/35=pic برای مارکر rs9384 در جمعیت مورد مطالعه بود. به علاوه بررسی تعادل هاردی واینبرگ نشان داد که جمعیت برای این مارکر در تعادل می باشد. نتیجه گیری: در مجموع با توجه به نتایج به دست آمده از مطالعه حاضر می توان مارکر rs9384 را به عنوان یک مارکر تک نوکلئوتیدی مناسب جهت تشخیص مولکولی گلوتاریک اسید یوریای نوع 1 در جمعیت اصفهان به عنوان نمونه ای از جمعیت ایرانی معرفی کرد.