همسانه سازی مولکولی ترادف رمزکننده ژن h+- atpase غشای پلاسمایی در گراس شورزی aeluropus littoralis
چکیده
پمپ پروتونی h+-atpase یکی از پروتئین¬های مهم موجود در غشای پلاسمایی گیاهان می¬باشد که نقش مهّمی در فیزیولوژی مولکولی پاسخ به تنش ایفاء می¬کند. گراس aeluropus littoralis بواسطه مقاومت به برخی از استرس¬های محیطی مثل تنش شوری و عناصر سنگین مدل خوبی برای مطالعه ساختار و عملکرد این پمپ می¬باشد. در این مطالعه بعنوان نقطه آغاز، ترادف کامل ناحیه کدکننده این ژن در هالوفیت aeluropus littoralis شناسایی و همسانه¬سازی شد. اطلاعات اولیه بدست آمده نشان می¬دهد ترادف نوکلئوتیدی پمپ پروتونی h+-atpase غشای پلاسمایی یک ناحیه orf کامل بطول bp 2856 می¬باشد که همولوژی معنی¬داری با گونه¬های sorghum bicolor ، oryza sativa و zea mays دارد. همچنین ترادف آمینواسیدی این ژن، پپتیدی با وزن مولکولی 104567 دالتون متشکل از 951 اسیدآمینه را رمز می¬کند که از نظر نوع و ساختار دامین، بیشترین تطابق را با پروتئین¬های h+-atpase غشای پلاسمایی گیاهی و قارچی نوع سوم (type iii) از خانواده بزرگ پمپ¬های atpase p-type دارد. همردیفی مقایسه¬ای ترادف آمینواسیدی ژن h+-atpase غشای پلاسمایی گیاه aeluropus littoralis (alha) برخی گونه¬ها نشان می¬دهد که جایگزینی¬های نوکلئوتیدی نقاط حساس و عملکردی پروتئین را هدف قرار نداده و این مناطق در توالی مورد بررسی، حفاظت¬شده باقی مانده¬اند. در نهایت این ترادف با شماره دسترسیgi:346230720 در پایگاه داده ncbi ثبت گردید.