ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در چند استان شمالی ایران *
چکیده
باکتری (pss) pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماری های بسیاری روی محصولات زراعی و باغی می باشد یکی از مهم ترین بیماری های ناشی از این باکتری شانکر، لکه برگی و نکروز پوست در درختان میوه هسته دار (هلو، شلیل، زردآلو، آلو و گیلاس) است. به منظور بررسی همسانی یا تنوع جدایه های عامل بیماری، طی سال های 1386-1388 از باغات درختان میوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان های اردبیل، گیلان، مازندران و خراسان رضوی نمونه برداری صورت گرفت. باکتری های جداشده از بافت های آلوده جوانه، برگ، شاخه و تنه بر اساس آزمون های گروه lopat و gatta، pss شناسایی شدند. تعداد 70 جدایه مورد بررسی های فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیک و بیوشیمیایی) و الکتروفورز پروتئین های سلولی ( sds-page) قرار گرفتند. جدایه ها از نظر خصوصیات فنوتیپی و الگوی پروتئین های سلولی اختلاف های جزئی نشان دادند. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی، dna ژنومی جدایه ها استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز (rep-pcr) با استفاده از آغازگرهای eric و rep بررسی شد. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده نشان داد که در eric-pcr در سطح تشابه 75 درصد، جدایه ها به 8 گروه و با rep-pcr به 5 گروه و با ترکیب همه آغازگرها به 9 گروه تقسیم شدند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایه های pss عامل بیماری شانکر درختان میوه هسته دار بود.