راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده

الهام احمدی

پایان‌نامه

راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده

دانلود متن کاملرایگان، با حساب کاربری؛ ثبت نام با گوگل چند ثانیه است

چکیده

چکیده گروه a روتاویروس بیشترین عامل مهم گاستروانتریت ویروسی انسان در جهان است، بنابراین تشخیص و درمان این بیماری از اهمیت ویژه ای برخوردار است. تصور بر این است که تغییرات آنتی ژنیک شیفت، دریفت و بازآرایی ژنومی درون یک قطعه، مکانیسم های تکاملی روتاویروس باشند. تکثیر متوالی ویروس با moi بالا در کشت سلول و همچنین عفونت های مزمن در گروه-های هدف با نقص ایمنی، در تکامل آن نقش دارد. از آنجا که مطالعات قطعات بازآرایی شده برای تشخیص توالی های ضروری برای تکثیر و بسته بندی مفید است، هدف از انجام مطالعه ی حاضر بررسی توانایی روشpoly(a)-tailed universal reverse transcription pcr در تشخیص قطعات استاندارد و بازآرایی شده است. با این هدف، راندمان تکثیر با این روش، برای تکثیر سویه ی rf از روتاویروس گاوی بررسی شد. ما توانایی روش poly(a)-rt-pcr پس از page و رنگ آمیزی نیترات نقره را برای ردیابی ویژه دو قطعه ی بازآرایی شده ارزیابی نمودیم. برای استفاده از این روش روتاویروس روی رده ی سلولی ma-104 متراکم تک لایه ای با moi یک، کشت داده شد و هر پاساژ برای بررسی بیشتر پروفایل های ژنومی توسط ژل پلی آکریل آمید 10 درصد به مقادیرمورد استفاده تقسیم و فریز شد. ژنوم rna دو رشته ای استخراج و توسط پلی آدنیلاسیون دم پلی آ در انتهای 3^ ژنوم هدف تک رشته ای افزوده شد و سپسrna برچسب دار برای تکثیر و ردیابی قطعات استاندارد و بازآرایی شده روتاویروس سویه یrf استاندارد و بازآرایی شده با استفاده از rt-pcr استفاده شد. cdna توسط آغازگر طراحی شده از zebra fish و بدون استفاده از آغازگرهای از قبل طراحی شده تولید شد. به منظور تایید امکان این رهیافت، rt-pcr با آغازگرهای اختصاصی و ژنوم اصلاح نشده نیزانجام شد. نتایج، بازآرایی ژن از طریق پاساژهای سریالی روتاویروس را نشان داد، که طی آن ژن های nsp1وnsp3 با الگوی مهاجرت متفاوت در الکتروفورز ژل پلی آکریل آمید و در زمینه ای ازهمتاهای استاندارد مشاهده شدند. بر خلاف قطعات استاندارد تکثیر ضعیف قطعات بازآرایی شده بیش از همتایان استاندارد خود نشان داده شد، که شاید به دلیل توالی کوتاه در قطعات استاندارد باشد. نتایج تاکید می کند که rt-pcr نسبت به انواع بازآرایی شده تمایل به تکثیر الگوهای کوتاه دارد و نمی تواند برای ردیابی توالی های بازآرایی شده در زمینه ای ازتوالی های همولوگ استاندارد استفاده شود، بنابراین poly(a)-rt-pcr توسعه یافت. در این مطالعه یک دستورالعمل جدید برای تولید cdna با طول کامل از rna های غیر آدنیله (بدون دم پلی آ) برای روتاویروس معرفی شده است. مشکلات بالقوه در طی مطالعه نشان می دهد که احتمالا متابولیت هایی در طی تکثیر روتا ویروس تولید می شود که به پلی آدنیلاسیون مقاومت نشان می دهد، که اثبات آن نیاز به مطالعه بیشتر دارد

اساتید راهنما و مشاور

حوریه سلیمان جاهی، مجید صادقی زاده

دانلود متن کامل

نسخه‌ی محفوظ در ویراساینس

برای دانلود رایگان وارد شوید یا ثبت نام کنید

دانشگاه: دانشگاه تربیت مدرس
زمینه: پزشکی
سال: ۱۳۹۱

ذخیره در کتابخانه

استناد

الهام احمدی (2012). راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده. https://www.virascience.com/thesis/585913/

@phdthesis{احمدی2012,
  title = {راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده},
  author = {الهام احمدی},
  year = {2012},
  school = {وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده پزشکی},
  url = {https://www.virascience.com/thesis/585913/}
}

TY  - THES
TI  - راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده
AU  - الهام احمدی
PY  - 2012
UR  - https://www.virascience.com/thesis/585913/
ER  -

[
  {
    "id": "thesis:585913",
    "type": "thesis",
    "title": "راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده",
    "author": [
      {
        "literal": "الهام احمدی"
      }
    ],
    "URL": "https://www.virascience.com/thesis/585913/",
    "language": "fa",
    "issued": {
      "date-parts": [
        [
          2012
        ]
      ]
    },
    "publisher": "وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده پزشکی"
  }
]

BibTeX · RIS · CSL-JSON

این موضوع در پایان‌نامه‌ها

کلیدواژه‌ها

اسناد مشابه

A comparative study of microbial diversity and community structure in marine sediments using poly(A) tailing and reverse transcription-PCR
سند علمی۲۰۱۳Front. Microbiol.Tatsuhiko Hoshino, Fumio Inagaki
To obtain a better understanding of metabolically active microbial communities, we tested a molecular ecological approach using poly(A) tailing of environmental 16S rRNA, followed by full-length complementary DNA (cDNA) synthesis and sequencing to eliminate potential biases cause
A comparative study of microbial diversity and community structure in marine sediments using poly(A) tailing and reverse transcription-PCR
مقاله‌ی دسترسی آزاد۲۰۱۳Frontiers in MicrobiologyTatsuhikoHoshino, FumioInagaki
To obtain a better understanding of metabolically active microbial communities, we tested a molecular ecological approach using poly(A) tailing of environmental 16S rRNA, followed by full-length complementary DNA (cDNA) synthesis and sequencing to eliminate potential biases cause
A one-tube method of reverse transcription-PCR to efficiently amplify a 3-kilobase region from the RNA polymerase gene to the poly(A) tail of small round-structured viruses (Norwalk-like viruses)
مقاله‌ی دسترسی آزاد۱۹۹۷Journal of Clinical MicrobiologyTAndo, S SMonroe, J SNoel, R IGlass
Amplification of a 3-kb genome region from the RNA polymerase gene to the 3' poly(A) tail of small round-structured virus (SRSV) by reverse transcription-PCR (RT-PCR) has been difficult to achieve because of a stable secondary structure in a region between the RNA polymerase gene
A one-tube method of reverse transcription-PCR to efficiently amplify a 3-kilobase region from the RNA polymerase gene to the poly(A) tail of small round-structured viruses (Norwalk-like viruses).
سند علمی۱۹۹۷Journal of clinical microbiologyT Ando, S S Monroe, J S Noel, R I Glass
Amplification of a 3-kb genome region from the RNA polymerase gene to the 3' poly(A) tail of small round-structured virus (SRSV) by reverse transcription-PCR (RT-PCR) has been difficult to achieve because of a stable secondary structure in a region between the RNA polymerase gene

راه اندازی روش pcr poly (a) -tailed universal reverse transcription برای تکثیر غیر وابسته به توالی روتا ویروس گاوی بازآرایی شده

چکیده

اساتید راهنما و مشاور

اسناد مشابه

A comparative study of microbial diversity and community structure in marine sediments using poly(A) tailing and reverse transcription-PCR

A comparative study of microbial diversity and community structure in marine sediments using poly(A) tailing and reverse transcription-PCR

A one-tube method of reverse transcription-PCR to efficiently amplify a 3-kilobase region from the RNA polymerase gene to the poly(A) tail of small round-structured viruses (Norwalk-like viruses)

A one-tube method of reverse transcription-PCR to efficiently amplify a 3-kilobase region from the RNA polymerase gene to the poly(A) tail of small round-structured viruses (Norwalk-like viruses).