مطالعه طیفسنجی و دینامیک مولکولی برهمکنش کمپلکسهای پالادیوم (ii) از لیگاندهای فنانترولین و مشتقات گلایسین با dna غده تیموس گوساله (dna-ct)
چکیده
مطالعه برهمکنش بین کمپلکسهای پالادیوم (ii) و dna برای کشف دارو بسیار مهم میباشد. در این مطالعه به دلیل پیوند قوی بین پالادیوم با dna، سه ساختار کمپلکسهای پالادیوم (ii) با فرمول [pd(phen)(r-gly)]no3 انتخاب شدند که phen (فنانترولین) و r-gly (متیل، پروپیل و آمیل-گلایسین) میباشد. برهمکنش سه کمپلکس پالادیوم (ii) با ct-dna به وسیلهی روشهای جذب uv، نشر فلوئورسانس، دورنگنمایی دورانی، ویسکوزیته، ولتامتری چرخهای و همچنین شبیهسازی دینامیک مولکولی (md) و داکینگ مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. این کمپلکسها با dna در محلول بافر تریس حاوی کلرید سدیم 10 میلیمولار (ph=7.4)، در دمای 27 و37 درجه سانتیگراد (سلسیوس) برهمکنش داشتند. نتایج تجربی نشان میدهد که برهمکنش این کمپلکسها با dna از نوع اینترکلیشن بود. علاوه بر این، برهمکنش کمپلکسهای پالادیوم (ii) با dna در غلضتها و دماهای بالاتر بیشتر بود. در نهایت پارامترهای ساختاری به دست آمده از شبیهسازی (md) نشان داد که این کمپلکسها پیوند هیدروژنی مولکولی را کاهش داده و با ct-dna اینترکلیت شدند. نتایج محاسبات توافق خوبی با مطالعات تجربی داشتند.
