بررسی چندشکلی اگزون 4 ژن esr1 و اگزون 2 ژن gdf9 با روشpcr-sscp و ارتباط آن ها با توانایی تولیدمثلی در گوسفندان مهربان و لری
چکیده
ژن های esr1و gdf9 به عنوان دو ژن کاندیدا برای صفات تولید مثلی از جمله چند قلو زایی و نرخ تخمک ریزی در گونه های مختلف حیوانات مانند گوسفند شناسایی شده اند. در مطالعه ی حاضر، چند شکلی های ژن های esr1 و gdf9 با استفاده از روش چند شکلی فضایی تک رشته ای (sscp) و توالی یابی dna در 100 میش نژاد مهربان و 100 میش نژاد لری مورد ارزیابی قرار گرفت. در هر نژاد 15 رأس از میش ها دارای بیشترین چندقلوزایی و 85 رأس باقیمانده بطور تصادفی انتخاب شدند. لذا بررسی چند شکلی با کمک 85 نمونه تصادفی و بررسی ارتباط با صفات تولید مثلی از روی همه ی نمونه ها انجام شد. در واکنش زنجیره ای پلیمراز یک قطعه ی 233 جفت بازی از اگزون 4 ژن esr1 و یک قطعه ی 342 جفت بازی از اگزون 2 ژن gdf9 تکثیر شدند. در میش های مهربان و لری یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی(snp) g?a با دو ژنوتیپ ag و gg در دو الگوی متفاوت sscp در ژن esr1 شناسایی گردید که منجر به تغییر آمینو اسید نشد. در ژنوتیپ ctg/cta در دو نژاد لری و مهربان برای اگزون 2 ژن gdf9 یک چندشکلی تک نوکلئوتیدی g?a شناسایی شد که منجر به تغییر آمینو اسید نگردید. در ژنوتیپ های ctg/atg و ctg/ccg به ترتیب دو چند شکلی تک نوکلئوتیدی c?a و t?c در نژاد مهربان برای اگزون 2 ژن gdf9 مشاهده شد. چند شکلی های تک نوکلئوتیدی c?a و t?c به ترتیب، منجر به تغییرات آمینو-اسیدی پرولین به ترئونین و فنیل آلانین به سرین شدند. مشاهده نشدن ژنوتیپ aa دراگزون 4 ژن esr1 و ژنوتیپ atg/atg اگزون 2 ژن gdf9 به اثرات احتمالی کشندگی یا ناباروری این ژنوتیپ ها نسبت داده شد. تعداد موثر آلل ها به همراه شاخص شانون و نی نشان دهنده تنوع نسبتاً بالاتر گوسفندان مهربان در مقایسه با گوسفندان لری بودنند. هیچ یک از چند شکلی های تک نوکلئوتیدی مشاهده شده در دو ژن esr1 و gdf9 در دو نژاد رابطه ی معنی داری با صفات تولید مثلی بررسی شده، شامل تعداد بره در هر زایش، تعداد بره متولد شده تا سن 4 سالگی، تعداد بره از شیرگیری شده تا سن 4 سالگی، میانگین وزن بره های متولد شده تا سن 4 سالگی، مجموع وزن بره های متولد شده تا سن 4سالگی، میانگین وزن بره-های از شیرگیری شده تا سن 4 سالگی و مجموع وزن بره های از شیرگیری شده تا سن 4سالگی نداشتند.