شناسایی مولکولی سیستم تنظیمی ژن acds سویه ی fy32 باکتری سودوموناس فلورسنس
چکیده
آنزیم acc deamiase با تبدیل acc به آمونیوم و ? -کتوبوتیرات میزان هورمون گیاهی اتیلن را کاهش می دهد. این آنزیم در گروهی از باکتری ها ی همزیست با گیاهان که به باکتری های pgpb )باکتری های افزایش دهنده رشد گیاهان( معروف هستند شناسایی شده است. آنزیم acc deaminase به وسیله ژن acds کد می شود. سیستم تنظیمی منحصر به فردی بیان ژن acds را کنترل می کند که شامل فاکتور های تنظیمی عمومی مانند crp و fnr به همراه پروتئین مشابه lrp به نام acdr می باشد. ژن acdr در بالادست ژن acds و در جهت مخالف آن قرار گرفته است. در مطالعه حاضر توالی تنظیمی ژن acds باکتری pseudomonas fluorescens fy32 بررسی شده است. ژن acds در این باکنری 2111 جفت باز طول دارد که ناحیه کدکننده آنزیم 2121 جفت باز، ژن acdr 21 جفت باز و ناحیه تنظیمی این دو ژن 111 جفت می باشد. بعد از طراحی پرایمر های مناسب بخش های مختلف ژن acds و در نهایت کل ژن ) 2111 جفت باز( تکثیر شد و در باکتری e. coli dh5? کلون گردید. بعد از بیان ژن acds در باکتری میزبان قطعه کلون شده تعیین توالی شد و ناحیه ی تنظیمی ژن های acds و acdr برای یافتن بخش های تنظیمی بررسی شد. استفاده از نرم افزار ها و جست جوی جعبه های اتصالی حفاظت شده نشان داد که توالی تنظیمی ژن های acds و acdr شامل دو جایگاه اتصال ریبوزوم ، جایگاه اتصال پروتئین شبه lrp (acdr) ، جایگاه اتصال fnr و جعبه های پروموتری -21 و 50 - می باشد. نکته قابل توجه حضور دو جایگاه اتصالی برای فاکتورهای تنظیمی rpon و nifa در این توالی تنظیمی می باشد. فاکتور های رونویسی rpon و nifa بیان ژن هایی را کنترل می کنند که به وسیله فاکتور 5 ? شناسایی می شوند. نهایتا، باشد. برای تعیین عملکرد دقیق این فاکتور های تنظیمی مطالعات بیشتری موردنیاز می