تشخیص برهمکنشهای مثبت کاذب در شبکههای برهم‌کنش پروتئین-پروتئین با استفاده از روش‌های محاسباتی
چکیده
پروتئین‌ها هرگز به صورت منفرد عمل نمیکنند، بلکه از طریق برهم‌کنش با دیگر پروتئین‌ها، عملکردهایشان را اجرا میکنند. بررسی این برهمکنشها، پایهای برای کشف مکانیسم‌های مولکولی، فرآیندها و مفاهیم زیستی مربوط به عملکردهای پروتئین‌ها میباشد. روش‌های آزمایشگاهی مقیاس بزرگ همانند mass spectrometry و yeast two-hybrid ، لیست وسیعی از برهمکنشهای پروتئین- پروتئین را فراهم آوردهاند، که این دادهها باعث افزایش قدرت تحقیقات و مطالعات حوزهی پروتئوم شده است. مطالعات اخیر نشان داده است که برهمکنشهای بدست آمده از روش‌های آزمایشگاهی حدودا دارای 50% خطای مثبت کاذب و منفی کاذب میباشند. خطاهایی که در برهمکنشهای پروتئین رخ داده است میتواند اکتشافات و تحقیقات را به سمت اشتباهی هدایت کند که هزینهی بسیار گزافی دارد، به عنوان مثال اشتباه در تشخیص عامل بیماریزا در طراحی دارو که هزینهی بسیار زیادی دارد، یکی از این اشتباهات میتواند میباشد. با توجه به مطالب ذکر شده، روشی برای شناسایی خطاهای مثبت کاذب بسیار ضروری میباشد.