طراحی نرم افزاری پپتید اختصاصی متصل شونده به کادمیم و ساخت سیستم نمایش سطحی باکتریایی براساس پیلی cs3 برای حذف فلزات سنگین با حداکثر تمایل به کادمیم
چکیده
عرضه سطحی باکتریایی با کمک متدهای dna نوترکیب روش توانمندی برای ارائه پروتئین ها و پپتیدهای همولوگ در سطح باکتری هاست که کاربردهای وسیعی در تهیه و تولید واکسن های باکتریایی، غربالگری کتابخانه های پپتیدی، تولید آنتی بادیها، تولید بیوکاتالیست های نوترکیب، توسعه بیوسنسورها و ایجاد جاذب-های بیولوژیکی دارد. لذا بنظر می رسد با بیان سطحی پروتئین ها یا پپتیدهای قابل اتصال به فلزات سنگین مانند گلوتاتیون ها، متالوتیونین های غنی از سیستئین، فیتوکلاتین های سنتزی و پپتیدهای موثر در نقل و انتقالات فلزات درباکتری ها، بتوان فلزات سنگین را در حداقل زمان از محیط های آلوده حذف نمود. در این مطالعه، ابتدا با کمک ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی، توالی پپتیدهای قابل اتصال به فلز کادمیوم استخراج گردید و نواحی مجاز دریافت پپتیدهای بیگانه در سطح پیلی cs3 باکتری اشریشیاکلی پیش گویی شد. سپس با فنون مهندسی ژنتیک و soeing pcr، موتیف های قابل اتصال به فلز کادمیوم در این مناطق وارد شده و بیان آنها در سطح باکتری اشریشیاکلی با روشهای متعدد از جمله روشهای لکه گذاری و میکروسکوپ فلوروسانس ارزیابی شد. در نهایت قابلیت و ظرفیت جذب فلز کادمیوم بوسیله باکتریهای نوترکیب، با روش جذباتمی اندازگیری گردید و نتایج نشانداد که بطور متوسط سطح جذب فلز در باکتری های بیان کننده پیلی نوترکیب واجد موتیف و یا موتیف به همراه زنجیره ? در مقایسه با سویه کنترل بیان کننده پیلی 8 الی 16 برابر شده است و علاوه بر این، سویه های نوترکیب از محلولی که شامل مخلوطی ازفلزات که شامل مس، نیکل، کادمیوم و کروم بود بطور ترجیحی و انتخابی کادمیوم را جذب می نمایند.