همسانه¬سازی و بررسی ژن های شبه سایکلوتاید در ذرت
چکیده
سایکلوتایدها دستهای بزرگ از پپتیدهای حلقوی هستند که فعالیتهای زیستی متنوعی دارند. از جمله میتوان به فعالیت ضد میکروبی، ضدتوموری، ضدویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلولکشی و حشرهکشی اشاره کرد. شبه سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده میباشند. در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظتشده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیکrace-pcr '3 ژن های کدکننده پروتئین های شبه سایکلوتاید در ذرت همسانه سازی و تعیین توالی شدند. مقایسه توالیهای بهدست آمده با توالیهای موجود در پایگاه دادههای ژنی pgi نشان داد که تعداد نه ژن شبهسایکلوتاید جدید در ذرت بهدست آمده است. مقایسه توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای این ژنها آنها را به دو دسته تقسیم کرد. دسته اول شباهت زیادی با سایر شبه سایکلوتاید های موجود در پایگاه دادههای ژنی داشته و دارای نواحی حفاظت شده سایکلوتایدی بودند. دسته دوم دارای ساختار منظم سایکلوتایدی نبودند و تعداد نوکلئوتید های این دو دسته از 485-413 متغیر بود. این اولــین گزارش در زمینه همسـانهسازی ژنهای شبهسایکلوتاید در گرامینهها بود و نشان داد که ذرت تنوع بالایی از این ژنها دارد.
نویسندگان و وابستگی سازمانی
- سمیرا ترکمن — دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
- بهمن بهرام¬نژاد — استادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
- نازنین کودری — دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج