نسب‏شناسی ژنی برای قطعه ‏توالی‏های افتراقی بیان شده trichoderma harzianum در طول کلونیزه شدن اسپرموسفر و سطح ریشة گوجه‏ فرنگی

مهدی مهرابی کوشکی، حمید روحانی، عصمت مهدیخانی مقدم

چکیده

بعضی سویه‏های تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیک علیه بیمارگرهای گیاهی استفاده شده اند. روش نمایش افتراقی تکثیر نسخه‏های معکوس mrna (ddrt-pcr) استفاده شد تا ژن‏های متمایز بیان شدة سویة t. harzianum t7 در طول مراحل کلونیزه شدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه ‏فرنگی ردیابی شود. تولیدات ddrt-pcr روی ژل ‏آگارز تفکیک و 42 باند افتراقی برش خالص‏سازی، همسانه ‏سازی و توالی‏یابی شد. قطعه ‏توالی‏ های بیان شده به دست آمده با استفاده از جست وجوی blast2go به پایگاه اطلاعات ncbi معرفی و نسب‏شناسی ژنی آنها بررسی شد. اغلب قطعه‏ توالی‏های بیان شده‏ مرتبط با پروتئین‏های شناخته شده یا فرضی بود. این پروتئین‏ها مرتبط با گروه‏ های کارکردی مختلف بودند و عمدتاً در سوخت وساز، انتقال سیگنال درون و بین سلولی، برهم کنش با میزبان، انتقال پروتئین، ترجمة پروتئین‏ها، کنترل رشد و بقای سلولی، عادت به تغییرات محیطی، انتقال مولکول‏های زیستی بین هسته و سیتوپلاسم، تنظیم کارکرد پروتئین‏ها، تقسیم سلولی، تسریع در واکنش‏های آنالوگ، تعمیر مولکول‏های آسیب دیده dna و دیگر کارکردهای حیاتی در موجودات مختلف نقش داشتند. بعضی قطعه ‏توالی‏های بیان شده ردیابی شده در این مطالعه مرتبط با ژن‏هایی بودند که آنزیم‏های درگیر در تأمین غذایی تریکودرما را در زیستگاه شان کد می‏کنند.