نسبشناسی ژنی برای قطعه توالیهای افتراقی بیان شده trichoderma harzianum در طول کلونیزه شدن اسپرموسفر و سطح ریشة گوجه فرنگی
Abstract(in Persian; no English abstract is available)
بعضی سویههای تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیک علیه بیمارگرهای گیاهی استفاده شده اند. روش نمایش افتراقی تکثیر نسخههای معکوس mrna (ddrt-pcr) استفاده شد تا ژنهای متمایز بیان شدة سویة t. harzianum t7 در طول مراحل کلونیزه شدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه فرنگی ردیابی شود. تولیدات ddrt-pcr روی ژل آگارز تفکیک و 42 باند افتراقی برش خالصسازی، همسانه سازی و توالییابی شد. قطعه توالی های بیان شده به دست آمده با استفاده از جست وجوی blast2go به پایگاه اطلاعات ncbi معرفی و نسبشناسی ژنی آنها بررسی شد. اغلب قطعه توالیهای بیان شده مرتبط با پروتئینهای شناخته شده یا فرضی بود. این پروتئینها مرتبط با گروه های کارکردی مختلف بودند و عمدتاً در سوخت وساز، انتقال سیگنال درون و بین سلولی، برهم کنش با میزبان، انتقال پروتئین، ترجمة پروتئینها، کنترل رشد و بقای سلولی، عادت به تغییرات محیطی، انتقال مولکولهای زیستی بین هسته و سیتوپلاسم، تنظیم کارکرد پروتئینها، تقسیم سلولی، تسریع در واکنشهای آنالوگ، تعمیر مولکولهای آسیب دیده dna و دیگر کارکردهای حیاتی در موجودات مختلف نقش داشتند. بعضی قطعه توالیهای بیان شده ردیابی شده در این مطالعه مرتبط با ژنهایی بودند که آنزیمهای درگیر در تأمین غذایی تریکودرما را در زیستگاه شان کد میکنند.
Authors and affiliations
- مهدی مهرابی کوشکی — استادیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران
- حمید روحانی — استاد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران
- عصمت مهدیخانی مقدم — دانشیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران