مقایسه روش بهینه شده استخراج dna از کپک های آسپرژیلوس، پنی سیلیوم و رایزوپوس در رب گوجه فرنگی
چکیده
چکیده در این تحقیق از روش بهینهسازی شده استخراج dna برای استخراج dna آسپرژیلوس نایجر، پنیسیلیوم کریزوژنوم و رایزوپوس اوریزا از رب گوجهفرنگی استفاده شد. روش مذکور مطابق با روش معرفی شده السامرایی بود که تغییراتی در غلظت محلولهای بافر استخراج و بعضی مراحل آن داده شد تا روش بهینهسازی شود. اسپور کپکهای مورد نظر در مقادیر مختلف (101، 103، 105 cfu/gr) به رب گوجه فرنگی اضافه شد و پس از رشد و ایجاد میسیلوم کپک استخراج dna انجام شد. dna های استخراج شده از نقطه نظر کمیت و کیفیت dna استخراج شده با استفاده از روش اسپکتروفتومتری با دستگاه نانودراپ مورد بررسی قرار گرفتند. همچنین با استفاده از الکتروفورز ژل dna استخراج شده از لحاظ عدم مشاهده هاله و نبود آلودگی پروتئینی مورد بررسی قرار گرفتند. جهت بررسی وجود ممانعت کننده های pcr در نمونه های dna استخراج شده عملیات pcr با استفاده از پرایمرهای پیشرونده و پسرونده طراحی شده انجام شد. نتایج نانودراپ و الکتروفورز ژل dna و نتایج pcr موید این مطلب است که این روش برای استخراج dna این کپک ها از رب گوجه فرنگی مناسب می-باشد.