مقاله

غربالگری کتابخانه نمایش فاژی برای شناسایی لیگاندهای پپتیدی متصل شونده به سلول‏های سرطانی روده انسان

babak bakhshinejad، department of genetics, faculty of biological sciences, tarbiat modares university, tehran, iran mohammad khalaj-kondori، department of biology, faculty of natural sciences, tabriz university, tabriz, iran saeedeh ghiasvand ghiasvand، department of genetics, faculty of biological sciences, tarbiat modares university, tehran, iran majid sadeghizadeh، department of genetics, faculty of biological sciences, tarbiat modares university, tehran, iran

چکیده

هدف: در سال‏های اخیر توجه ویژه‏ای به کتابخانه‏های نمایش فاژی به‏عنوان ابزارهایی برای شناسایی و جداسازی مولکول‏های دارویی (با خواص تشخیصی و درمانی) شده‏است. کتابخانه‏های پپتیدی یکی از مهم‏ترین و پرکاربردترین انواع کتابخانه‏های نمایش فاژی هستند. هدف از انجام پژوهش حاضر غربالگری کتابخانه نمایش فاژی پپتیدی ph.d.tm-7 از طریق فرآیند بیوپنینگ برای شناسایی لیگاندهای پپتیدی متصل شونده به سلول‏های sw480 (آدنوکارسینومای روده انسانی) بود. مواد و روش‏ها: سه دور بیوپنینگ روی سلول sw480 به‏عنوان سلول هدف و سلول‏های فیبروبلاست نرمال انسانی، آدنوکارسینومای معده انسانی، کارسینومای سلول‏های سنگفرشی مری انسانی و کارسینومای کبد انسانی به‏عنوان سلول‏های شاهد انجام شد. سپس با انجام plaque-pcr روی پلاک‏های به‏دست آمده از دور آخر بیوپنینگ قسمتی از ژنوم فاژهای متصل شونده به سلول sw480 که کد کننده پپتید نمایش یافته است، تکثیر و در گام بعد dna تکثیرشده تعیین توالی شد. از نرم‏افزارهای بیوانفورماتیکی برای شناسایی توالی پپتیدهای متصل شونده به سلول هدف و نیز بررسی برخی ویژگی‏های توالی‏های مزبور استفاده شد. نتایج: بیوپنینگ کتابخانه فاژی منجر به غنی‏سازی تعدادی پپتید شد که از بین آن‏ها توالی پپتیدی hamraqp دارای بیشترین فراوانی بود. بررسی بیوانفورماتیکی توالی‏های به‏دست آمده نشان داد که هیچ یک از آن‏ها جزء توالی‏های غیرمرتبط با هدف نیستند. نتیجه‏گیری: از پپتیدهای شناسایی شده، به ویژه توالی‏های پپتیدی با فراوانی بالا، به علت برخورداری از قابلیت اتصال اختصاصی به سلول sw480 می‏توان برای هدایت هدفمند ژن و دارو به سلول‏های بدخیم روده استفاده نمود.

اسناد مشابه