مقاله

تشخیص سریع rna ویروس hiv-۱ به وسیله روش real-time transcription mediated amplification

مهدی پریان، mahdi paryan pasteur instituteتهران.صادقیه.بلوار فردوس.خ سلیمی جهرمی.ک ظرافتی.پلاک 112 سمیرا محمدی یگانه، samira mohammadi yeganeh pasteur instituteانستیتوپاستور ایرانسازمان اصلی تایید شده: انستیتو پاستور ایران (pasteur institute of iran) بهزاد خوانساری نژاد، behzad khansari nejad tarbiat modares universityتربیت مدرسسازمان اصلی تایید شده: انستیتو پاستور ایران (pasteur institute of iran) مهدیه موندنی زاده، mahdieh mondanizadeh medical university of hamedanدانشگاه علوم پزشکی همدانسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (tarbiat modares university) سعید پریان، saeed paryan medical university of mashhadدانشگاه علوم پزشکی مشهدسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی همدان (hamadan university of medical sciences)

چکیده

زمینه و هدف: روش های ملکولی متعددی توسعه یافته اند که قادرند با حساسیت و ویژگی متفاوتی hiv-1 را در نمونه های بالینی تشخیص دهند. در این مقاله نتایج حاصل از یک مطالعۀ ارتباط سنجی در راه اندازی و به کارگیری یک روش real-time pcr tma نوین جهت تشخیص هم دمای ویروس hiv-1 ارائه شده است. مواد و روش ها: در این مطالعۀ مقطعی، ست پرایمر و پروب molecular beacon توسط نرم افزارهای اختصاصی و برای یک ناحیۀ 176 جفت بازی از ژن pol ویروس hiv-1 طراحی شد. برای تعیین حساسیت آنالیتیک واکنش از رقت های لگاریتمی 10-107 کپی rnaهای حاصل از رونویسی در آزمایشگاه، به عنوان استاندارد استفاده شد. برای ارزیابی حساسیت و ویژگی کلینیکی واکنش از نمونه های با لینی استفاده شد که پیش از این مثبت و منفی بودن آنها به وسیلۀ یک تست تجاری معتبر تایید شده بود. یافته ها: حساسیت آنالیتیک و کلینیکی این روش به ترتیب معدل 500 کپی در میلی لیتر و 3/93 درصد در نظر گرفته شد. پرایمرها و پروب طراحی شده تنها به توالی های اختصاصی hiv-1 متصل می گردند و مطالعات بیوانفورمانیکی هیچ گونه واکنش متقاطعی با ژنوم سایر ویروس های انتقال یابنده از طریق خون و ژنوم انسان نشان ندادند. ویژگی کلینیکی روش نیز به طور تجربی و با بررسی 20 نمونۀ منفی به وسیلۀ روش real-time tma راه اندازی شده، مورد آزمایش قرار گرفت و معادل 100 درصد در نظر گرفته شد. نتیجه گیری: روشtma real-time راه اندازی شده به علت دارا بودن سرعت، حساسیت و سادگی می تواند به عنوان ابزار مفیدی جهت تشخیص سریع و هم دمای ویروس hiv-1 در نمونه های خون و پلاسمای بیماران استفاده شود.

اسناد مشابه