به کار گیری روش high resolution melting در شناسایی چند شکلی های نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن stk۱۱ در مبتلایان به انواع سرطان های دستگاه گوارش

سیدجمال حسینی، seyed jamal hosseini reseacher member of society of biology, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iranپژوهشگرعضو انجمن زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن علی ناظمی، ali nazemi assistant professor, department of biology, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iranگروه بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن مهرداد هاشمی، mehrdad hashemi associate professor, department of molecular genetics, islamic azad university, tehran medical branch, tehran, iranگروه ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران پزشکی میرساعد میری نرگسی، mirsaed miri nargesi phd student of molecular genetics, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iranدانشجوی دکتری ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن شهرآشوب شریفی، shahr ashoob sharifi bs of genetics, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iranکارشناس ژنتیک، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن

Abstract(in Persian; no English abstract is available)

سابقه و هدف: آنالیز hrm (high resolution melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب dna در اثر خروج رنگ اندازه گیری می نماید. ژن stk11 یکی از پروتئین های خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز می نماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و هم چنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل می نماید. موتاسیون های ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم peutz-jeghers واستعداد ابتلاء به انواع نئوپلازی ها می باشند.روش بررسی: در این مطالعه تجربی، dna ژنومی از 56 بیمار مبتلا به انواع سرطان های دستگاه گوارش استخراج گردید. سپس ما تغیرات نوکلئوتیدی را در تمام طول ژن با استفاده از تکنیک real-time pcr و high(hrm) resolution melting بررسی نمودیم. یافته ها: غربالگری نوکلئوتیدی با تکنیک hrm دو نوع snp در اینترون های 6 و 7 در 10 بیمار را نشان داد. 4 بیماردارای تغییر نوکلئوتیدی c/t [cluster id/dssnp/rs9282860] در اینترون 6 به صورت هموزیگوس و شش بیمار دارای تغییر نوکلئوتیدی c/g [cluster id/dssnp/rs2075607] در اینترون 7 بصورت هتروزیگوس بودند. همچنین مقایسه نتایج hrm با نتایج تعیین توالی یک مطابقت 100 درصدی را نشان داد. نتیجه گیری: هر چند در این مطالعه موتاسیونی در بخش اگزون ژن مشاهده نگردید، به هر حال نتایج این مطالعه نشان می دهد غربالگری اولیه ژن stk11هم برای شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی ناشناخته ژرم لاین و هم سوماتیک در مبتلایان به نئوپلازی به منظور تشخیص علت بیماری از طریق روش hrm به سهولت و با هزینه نسبتا اندک قابل اجراء می باشد.