کاربرد روش re-snps در مطالعه های فیلوژنی باسیلوس آنتراسیس در ایران
Abstract(in Persian; no English abstract is available)
زمینه: علیرغم این که امروزه snp ژنوتایپینگ به عنوان روش استاندارد در مطالعه های تکاملی و همهگیرشناسی آنتراکس مطرح است، اما به دلیل نیاز به تعیین توالی در این روش، امکان اجرای آن در آزمایشگاههایی که با محدودیت بودجه مواجه هستند، وجود ندارد. هدف: مطالعه به منظور بررسی امکان استفاده از آنزیمهای محدودکننده در اجرای سیستم snp ژنوتایپینگ ون ارت van ert) ) انجام شد. مواد و روشها: این مطالعه کاربردی در سال 1393 در آزمایشگاه تحقیق و توسعه بخش واکسنهای هوازی دامپزشکی مؤسسه رازی کرج انجام شد. به منظور شناسایی آنزیمهای محدودکننده مناسب جهت هضم لوکوسهای snp ، قطعههای مربوطه بر روی ژنوم سویه 34f2 باسیلوس آنتراسیس بررسی شدند. صحت نتایج با استفاده از تعیین توالی محصولات pcr تأیید شد. یافتهها: از میان 13 لوکوس بررسی شده، 3 لوکوس به واسطه نوع snp خود، توسط آنزیمهای محدودکننده قابل افتراق بودند. قطعه 560 جفت بازی مربوط به لوکوس a.br004 در سویه استاندارد و جدایه حاد تحت تأثیر آنزیم bsmi قرار داده شد که دو قطعه با اندازههای 336 و 224 جفت باز حاصل شد . در بررسی امکان اجرای روش، سویه استاندارد به واسطه نوع snp خود توسط آنزیم شکسته شد. نتیجهگیری: با توجه به یافتهها به نظر میرسد پس از تکمیل فرآیند تحقیق، re-snp تایپینگ روشی ساده و مناسب جهت اجرای سیستم ژنوتایپینگ ون ارت باشد و نیاز به انجام روش پرهزینه تعیین توالی مرتفع شود.