پایان‌نامه

تجزیه و تحلیل دنباله dna بر اساس نظریه گراف

فریبا فیاضی

دانلود متن کاملرایگان، با حساب کاربری؛ ثبت نام با گوگل چند ثانیه است

چکیده

چکیده: تعیین شباهت دنباله ها یکی از مراحل مهم در مطالعات فیلوژنتیک ( شجره های وراثتی) محاسباتی است. همانطور که می دانیم، در طول تاریخ تکامل، نه تنها جهش dna، بلکه بازآرایی نوکلئوتیدها در دنباله dna برای هر فرد رخ می دهد. همین امر، زیست شناسان را درگیر محاسباتی برای توصیف ریاضی و تجزیه و تحلیل تشابه دنباله ها می کند. در این پایان نامه دو روش گرافی برای تجزیه و تحلیل دنباله های dna معرفی می کنیم. یکی از روش ها توسط زینکگین در سال 2011 معرفی شده است. وی برای هر دنباله dna، یک گراف جهت دار و وزن دار معرفی نمود. همچنین با استفاده از گراف جهت دار ماتریس مجاورت و بردار نماینده تعریف نمود. این روش روی مجموعه ای از kb-mt0.9 دنباله dna از دوازده گونه مختلف پستانداران تست شده است. روش دوم توسط ناتارجان در سال 2010 معرفی گردید. وی هر دنباله dna را به گراف خطی تبدیل نمود و شاخص اتصال را برای توصیف عددی معرفی کرده است و این روش نیز بر روی 23 ژن متفاوت آزمایش شده است. در ادامه، به معرفی دو روش جدید برای توصیف عددی دنباله های dna می پردازیم. در روش اول از دنباله مشخصه تعریف شده توسط هی و ونگ استفاده کرده و ضریب همبستگی را روی آن تعریف می کنیم. این روش را روی 8 گونه مختلف آزمایش می کنیم. در روش دوم با استفاده از نمایش گرافی دو بعدی معرفی شده توسط لئو، توزیع نرمال دو متغیره را روی دنباله های dna تعریف می کنیم. همچنین این روش را نیز روی 11 گونه متفاوت آزمایش میکنیم

اساتید راهنما و مشاور

علی ایرانمنش

پایان‌نامه‌های مشابه

اسناد مشابه

  • نظریه مرحله‎ای و تحلیل بقا بر اساس نظریه مشابهت زمانی

    مقاله۲۰۱۹فلسفهسید محمدعلی حجتی، طیبه شا‌هوردیان، محمد سعیدی مهر

    چهاربعدگرایی به عنوان یک هستی‎شناسی اشیای مادی بر این اعتقاد است که بقای اشیا در زمان، مشابه امتداد آنها در مکان است. یکی از نسخه‎های مهم این نظریه مشهور به نظریه مرحله‎ای، بر این باور است که اشیا عادی، مراحلی لحظه‎ای هستند که به واسطه داشتن مشابه‎های زمانی مختلف در زمان‎های مختل

  • تجزیه و تحلیل آزمون دروس دانشجویان کارشناسی بهداشت با استفاده از برنامه نرم افزاری آنالیز سؤالات چند گزینه ای بر اساس نظریه تستی کلاسیک (ctt)

    مقالهمجله ایرانی آموزش در علوم پزشکیمحمد مهدی امین، mohammad mehdi amin assistant professor, environment research center, isfahan university of medical sciences, hezarjarib st, isfahan, iranمحمد مهدی امین (استادیار)، مرکز تحقیقات محیط زیست، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران شهرام شایان، shahram shayan phd student of higher education management, medical education research center, isfahan university of medical sciences, isfahan, iranشهرام شایان، کارشناس ارشد مدیریت آموزشی، دانشجوی دکترای مدیریت آموزش عالی، مرکز تحقیقات آموزش پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران؛ حسن هاشمی، hassan hashemi phd student of environment health, environment research center, isfahan university of medical sciences, isfahan, iranحسن هاشمی، دانشجوی دکترای مهندسی بهداشت محیط، مرکز تحقیقات محیط زیست، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران پریناز پورصفا

    مقدمه: هدف از انجام این مطالعه، استفاده از نرم افزار نظریه تستی کلاسیک برای تجزیه و تحلیل کمی و کیفی سؤالات چند گزینه ای برای دانشجویان مقطع کارشناسی رشته بهداشت می باشد. روش ها: این مطالعه بر روی دو گروه 50 نفری از دانشجویان کارشناسی رشته بهداشت عمومی و دو گروه 50 و 26 نفری از د

  • تجزیه و تحلیل جنبش وال استریت بر اساس نظریة هابرماس

    مقاله۲۰۱۴جستارهای سیاسی معاصرحسین هرسیج، رئوف رحیمی، ملیحه رمضانی

    چکیده جنبش وال استریت نمایان گر اعتراض مردم به عملکرد نظام سرمایه داری است و به منزلة یکی از مهم ترین رخدادها و تحولات جامعة امریکا در سال 2011 محسوب می شود. اهمیت این موضوع از آن رو است که برخلاف سایر جنبش ها محدود به حوزة خاصی نیست و توانسته است به تدریج به سایر نقاط جهان تسری

  • تجزیه و تحلیل جنبش وال استریت بر اساس نظریه هابرماس

    مقالهجستارهای سیاسی معاصرحسین هرسیج، دانشیارعلوم سیاسی، دانشگاه اصفهان رئوف رحیمی، دانشجوی دکتری علوم سیاسی،دانشگاه اصفهان ملیحه رمضانی، دانشجوی دکتری علوم سیاسی دانشگاه اصفهان

    چکیده جنبش وال استریت نمایان گر اعتراض مردم به عملکرد نظام سرمایه داری است و به منزله یکی از مهم ترین رخدادها و تحولات جامعه امریکا در سال 2011 محسوب می شود. اهمیت این موضوع از آن رو است که برخلاف سایر جنبش ها محدود به حوزه خاصی نیست و توانسته است به تدریج به سایر نقاط جهان تسری

  • تجزیه و تحلیل جنبش وال‌استریت بر اساس نظریة هابرماس

    مقاله۲۰۱۴جستارهای سیاسی معاصرحسین هرسیج، رئوف رحیمی، ملیحه رمضانی

    چکیده جنبش وال‌استریت نمایان‌گر اعتراض مردم به عملکرد نظام سرمایه‌داری است و به منزلة یکی از مهم‌ترین رخدادها و تحولات جامعة امریکا در سال 2011 محسوب می‌شود. اهمیت این موضوع از آن‌رو است که برخلاف سایر جنبش‌ها محدود به حوزة خاصی نیست و توانسته است به‌تدریج به سایر نقاط جهان تسری

  • کاربرد و بسط نظریه گراف در روش نحو فضا تدوین مدل کاربردی تحلیل در معماری

    مقاله۲۰۲۱مرمت و معماری ایرانوجیهه ملایی شمس، علیرضا رضوانی، مجید میرزاوزیری

    چکیده در چند دهه‌اخیر، روش‌های مختلفی برگرفته از دانش ریاضیات جهت طراحی و تحلیل فضاهای معماری به‌کار رفته‌اند. در این میان نظریه‌گراف، مدلی انتزاعی برای مطالعه‌سازمان‌یابی فضایی ارائه‌می‌دهد؛ به‌طوری‌که یک چارچوب ریاضی ساده و انعطاف‌پذیر جهت تحلیل ویژگی‌های توپولوژیک فضایی و ارتب