جداسازی و همسانه سازی ژن اندو 1و4 بتا زایلاناز a از باکتری nesterenkonia sp.strain f در باکتری e.coli.

هاجر محمدی

چکیده

nestrenconia sp.strain.f یک جنس نمک دوست از خانواده micrococcacae است که ژنوم آن غنی از cg است. توسط نرم افزار rast ژنوم باکتری را بررسی کردیم. این بررسی نشان داد که ژنوم باکتری حاوی ژن endo-1,4-beta-xylanase است. پروتئین های اندو 1و4 بتا زایلاناز ( ec 3.2.1.8) آنزیم های هیدرولاز هستند که پیوند های 1-4 گلیکوزیدیک را در مولکول زایلان از ترکیب همی سلولوز می شکند.مطالعات دینامیک مولکولی مشخص کرد که این آنزیم دارای جایگاه اتصال به سوبسترای زایلان و برخی کوفاکتور های احتمالی است. همچنین مشخص شد که علارغم وجود تفاوت در توالی آمینو اسیدی، این پروتئین قادر است زایلان را به عنوان سوبسترا تشخیص دهد و می تواند عملکرد آنزیمی خود را روی آن اعمال کند.

اساتید راهنما و مشاور

حمید گله داری، محمد شفیعی، سعید رضا خاتمی