ارزیابی تصحیح اثر لبه در عملکرد روش های blast و h-tuple با استفاده از منحنی roc
چکیده
هم ترازی بهینه یک ابزار ضروری جهت شناسایی عملکرد یک توالی زیستی برای زیست شناسان است. از جمله ابزار هایی که این هم ترازی بهینه و معنی داری آماری آن را محاسبه می کنند می توان به روش های blast و h-tupleاشاره کرد. تصحیح اثر لبه، روشی در بهبود معنی داری آماری هم ترازی بهینه می باشد. تصحیح اثر لبه در روش blast بررسی شده است. ما در این پایان نامه، تصحیح اثر لبه و تاثیر آن بر روش h-tuple را بررسی کرده و آن را با روش blast، با استفاده از منحنی roc، بر روی داده های واقعی مقایسه می کنیم. نتایج حاصل نشان می دهد که تصحیح اثر لبه کارایی هر دو روش را افزایش می دهد. همچنین روش h-tuple با تصحیح اثر لبه و بدون آن از روش blast کاراتر می باشد.